한국침례교회의 역사는 1898년 서울에 도착한 캐나다 독립선교사 말콤 펜윅(Malcom C. Fenwick)의 선교사업으로부터 시작 되었다.

이후 침례교는 일제 탄압기와 해방 후 혼란기를 거치는 와중에도 생명을 이어왔다.

1950년 한국 침례교는 미국 남침례교단과 선교 협정을 체결하고 발전과 번영의 전기를 마련한 이후 전도와 선교를 지상목표로 신앙정신을 구현하는 교단이 되기 위해 노력하고 있다.

1999년 서울 잠실주경기장에서는 침례교회 110주년 행사가 10만 성도가 참가한 가운데 성대하게 개회되었다.

2000년 1월 호주에서 개최된 침례교세계대회에서는 김장환 목사(현 수원중앙침례교회 원로목사)가 침례교세계연맹(BWA) 총재로 선출됐다.

한국침례교단은 이처럼 세계 속의 교단으로 성장하고 있다.